Ο Γιάννης Νικολής εκπαιδεύτηκε στην ομαδική ανάλυση. Είναι πλήρες μέλος της Group Analytic Society International και Ιδρυτικό μέλος του Ελληνικού Δικτύου Ομαδικών Αναλυτών.

Αναγορεύθηκε σε διδάκτορας ψυχιατρικής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης το 1996.

Απασχολήθηκε ως Ψυχίατρος - Ψυχοθεραπευτής για περισσότερα από 20 έτη σε θέσεις ευθύνης όπως ως υπεύθυνος του συμβουλευτικού σταθμού νέων.

Εργάσθηκε στο ΕΣΥ για 12 έτη όπου πέραν των προβλημάτων ψυχικής υγείας ασχολήθηκε εκτενώς με ψυχοσωματικούς ασθενείς και ψυχοσωματική ιατρική.

Στη διάρκεια της εργασίας του, ως Διευθυντής Ψυχιατρικής, στο «Θεαγένειο» Αντικαρκινικό Νοσοκομείο ασχολήθηκε εκτενώς με Ψυχοθεραπεία Ασθενών με καρκίνο. Επιπρόσθετα, συμμετείχε σε πολλαπλές εκπαιδευτικές και επιστημονικές δραστηριότητες σε θέματα Ψυχο-ογκολογίας.  Επίσης  οργάνωσε και συντόνισε Ομάδες Υποστήριξης Νοσηλευτριών

Το 2019, αποχωρώντας από την «κρατική υγεία», ίδρυσε το Ινστιτούτο Ψυχοθεραπείας και Προσωπικής Ανάπτυξης το οποίο και διευθύνει.